ImageJ （Fiji） の拡張をJython で書くとき，よくある感じで if __name__ == '__main__': ... というのを書いてたんですが，突然これやってる拡張が動かなくなりました． 調べてみると，どうやら __name__ が __builtin__ になっているらしい． 一応Forumで…

ImageJ の GUI plugin を作っていて，ボタンを押したときに一回目は動くのだけれど，なぜか2回目以降は NameError で import した module が認識されない． 実験した限りだと，下のスクリプトで何回か画像を開いて閉じてしていると，5回目ぐらいから NameErr…

最近 Overlay と ROI を管理するやつを作っていて console: Failed to install '': java.nio.charset.UnsupportedCharsetException: cp0. というエラーが出るようになり，調べていたら，2.7だということに気づいた． http://bugs.jython.org/issue2222%3Ebug…

LeafAreaという R から ImageJ を動かして葉面積を測定できるべんりパッケージがあるんですが，Fiji だとうまく動きません． というのは，ImageJ と Fiji ではフォルダ構造とかファイル名とかが異なるからです． LeafArea package が想定しているフォルダ構…

ImageJ は Python でマクロやらプラグインやらが書ける． しかし，Python2.5互換のJythonなので，結構つらい． APIドキュメントを延々と読んだりするのもつらい． 調べながら書いていると画像解析に詳しくなったり ImageJ に詳しくなったりJavaに詳しくなっ…