ImageJ （Fiji） の拡張をJython で書くとき，よくある感じで
if __name__ == '__main__': ...
というのを書いてたんですが，突然これやってる拡張が動かなくなりました．
調べてみると，どうやら __name__ が __builtin__ になっているらしい．
一応Forumでも話題が出ており，scijava-common の方の最近の変更が原因らしいですが，どの部分かは不明．
ワークアラウンドとして，
if __name__ in ['__main__', '__builtin__']: ...
が提案されてますが，元の挙動が正常なのでなおってほしい．
